EndoFree Plasmid Maxi Kit將高效的內毒素去除步驟整合到質粒純化過程中，不需要額外步驟，也不需用親和柱去除脂多糖。通過QIAfilter Maxi Cartridge過濾細菌裂解液，通過重力流QIAGEN-tip 500陰離子交換柱純化質粒DNA。100–250 ml培養菌液至多可純化500 µg DNA。（培養量取決于質粒拷貝數量、插入片段大小、宿主菌和培養介質。）純化的DNA無內毒素（<0.1 EU/µg DNA）。

EndoFree Plasmid Kits去除細菌在裂解過程中釋放的內毒素，內毒素會影響原代細胞和敏感培養細胞的DNA轉染。從EndoFree Plasmid Kits得到的無內毒素DNA高度適用于可重復且結果可靠的轉染。QIAGEN超純無內毒素DNA也適用于基因治療研究和其他敏感應用。

純化的質粒DNA內毒素污染水平取決于所用的純化方法。硅膠技術純化的DNA具有非常高的內毒素水平。QIAGEN、QIAfilter、HiSpeed Plasmid Kits和兩次CsCl超速離心可獲得相對低水平內毒素的純DNA。EndoFree Plasmid Buffer Set包含完整的內毒素去除步驟，獲得<0.1 EU/µg的質粒DNA。